По результатам оценки результативности научных организаций присвоена 2-я категория (приказ ФАНО России № 157 от 30.03.2018).
12 ноября 2020 года д.г.-м.н. Цыганков Андрей Александрович избран директором Геологического института СО РАН.
В 1958 г. в составе Бурятского комплексного научно-исследовательского института (БКНИ) был создан Отдел геологии. Геологический институт организован 07.03.1973 года на базе Отдела геологии Бурятского филиала СО АН СССР (распоряжение Совета министров РСФСР № 254-р) как Геологический институт Бурятского филиала СО АН СССР. Переименован в Геологический институт СО АН СССР (постановление Президиума СО АН СССР от 02.01.1989 № 9), Бурятский геологический институт СО АН СССР (постановление Президиума АН СССР от 27.06.1989 № 579), Геологический институт СО РАН (постановление Президиума СО РАН от 25.09.1997 № 350), Учреждение Российской академии наук Геологический институт Сибирского отделения РАН (постановление Президиума РАН от 18.12.2007 № 274), Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Геологический институт Сибирского отделения Российской академии наук (постановление Президиума РАН от 13.12.2011г. № 262). В 2021 году Институту присвоено почетное наименование им. Н.Л. Добрецова (Приказ Минобрнауки России от 29.12.2021 № 1697).
Первым директором института был Ф.П. Кренделев (1973-1980 гг.). В 1980 г. директором был назначен ученый с мировым именем Н.Л. Добрецов (1980-1989 гг.), затем Э.Г. Конников (1989-1995 гг.), А.Г. Миронов (1996-2009 гг.), Г.И. Татьков (2009-2013 гг.). В настоящее время институт возглавляет д.г.-м.н. А.А. Цыганков.